肠内营养在MODS治疗中的作用，鉴于从肠道摄取营养物质对维持肠黏膜屏障功能极为重要，提倡有关病人宜尽量自己进食。
预期数日内不能经口摄食满足其营养需求时，必须尽早开始营养支持。营养支持的途径分为肠内、肠外两种，对胃肠功能正常的危重病人首先考虑肠内营养途径。通过各种管饲或胃肠道造口的方法向小肠内输注营养液。胃肠有病变者只得采取肠外营养途径。目前公认，对创伤、大手术及危重病人早期提供肠内营养特别是不间断营养效果较肠外营养为佳，能改善SIRS、感染、器官衰竭，降低死亡率。常规的肠内营养液含足够的蛋白质、氨基酸、脂肪、碳水化合物、维生素和微量元素。
对普通患者作营养支持以保持热量平衡；而对严重创伤及感染患者要作代谢支持保持正氮平衡。即针对MODS 时高分解代谢的特点，要提高蛋白质和氨基酸的摄入量，限制糖的摄入，使热氮比值维持在100：1 左右。提高支链氨基酸的比例，并增加谷氨酰胺。还有一些免疫增强配方，含有精氨酸、核酸、n-3 脂肪酸、抗氧化剂及纤维素等。鱼油中富含n-3 不饱和脂肪酸，它刺激免疫系统，抑制巨噬细胞活化，抑制其产生IL-1β和TNF-α，减少PGF1α、TXA2 和PGE2 产生，因而减轻炎症反应。有报道危重病患者经胃肠道补充n-3 脂肪酸后，SIRS 和MODS 发生率明显降低。