在人体病理学方面关于过氧体的病变知之尚少。
1.过氧体增多
动物实验中，在切除甲状腺、给予皮质激素或氨基水杨酸后以及在实验性致癌过程中，可见过氧体增多。在人体的某些病理过程如某些炎症（病毒性肝炎、螺旋体感染）及慢性酒精中毒等时也可见到过氧体增多现象。
2.过氧体减少或缺如
在较罕见的脑肝肾综合症（Zellweger综合征）时，曾见到过氧体缺如的现象，但其病理意义尚不清楚。
3.微过氧体
为一组同样含有过氧化物酶和触酶的小体，但远较过氧化为小（0.15～0.25μm），不含核芯结构，与光面内质网相连。因此被认为是光面内质网的特化部分及过氧体的前身，其作用尚未查明。